El jefe de Planeamiento en un informe ya alertó en 2016 que la comisión, «en varios aspectos relevantes, no se ajusta a lo establecido en la Guía de la Generalitat. En concreto en ella adquiere especial protagonismo la figura del 'Departamento competente en evaluación ambiental y territorial estratégica', encargado de instruir y tramitar los expedientes del procedimiento de evaluación y que no figura en la propuesta de Reglamento de Organización. Esta función específica no puede ser realizada por la propia comisión ni por el departamento o técnico encargado de urbanismo tal y como se propone, ya que en este último caso se produciría una duplicidad de funciones incompatibles».
